Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms