Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcf11G3X9Z4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms