Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms