Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms