Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3G3X939 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms