Protein–RNA interactions for Protein: F6XJP7

Pcsk6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk6F6XJP7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk6F6XJP7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms