Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6619F6URP1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms