Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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