Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Raph1F2Z3U3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms