Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A430078G23RikE9Q7Y4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430078G23RikE9Q7Y4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms