Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms