Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip11E9Q512 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip11E9Q512 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms