Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn2r56E9Q4U5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms