Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccdc71lE9Q4T4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccdc71lE9Q4T4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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