Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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