Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms