Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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