Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Pdzd2E9Q1M1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Pdzd2E9Q1M1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Pdzd2E9Q1M1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Pdzd2E9Q1M1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Pdzd2E9Q1M1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Pdzd2E9Q1M1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pdzd2E9Q1M1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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