Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms