Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms