Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms