Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms