Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms