Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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