Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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