Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif28pD3YXS5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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