Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms