Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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