Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clrn2B2RVW2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms