Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rd3lB2RV38 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rd3lB2RV38 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rd3lB2RV38 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rd3lB2RV38 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rd3lB2RV38 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rd3lB2RV38 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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