Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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