Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7aB2RT54 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol7aB2RT54 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms