Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rrn3B2RS91 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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