Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms