Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf3B2RQG2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf3B2RQG2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms