Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms