Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Trabd2bB1ATG9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Trabd2bB1ATG9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Trabd2bB1ATG9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Trabd2bB1ATG9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms