Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms