Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms