Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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H2-M5A7VMS3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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H2-M5A7VMS3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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H2-M5A7VMS3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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H2-M5A7VMS3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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H2-M5A7VMS3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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H2-M5A7VMS3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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H2-M5A7VMS3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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H2-M5A7VMS3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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H2-M5A7VMS3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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H2-M5A7VMS3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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