Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms