Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Atp8b5A3FIN4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Atp8b5A3FIN4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms