Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Catsper2A2ARP9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper2A2ARP9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms