Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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