Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll9A2APC3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms