Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Camsap1A2AHC3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Camsap1A2AHC3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms