Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramel3A2AHA7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramel3A2AHA7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramel3A2AHA7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramel3A2AHA7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramel3A2AHA7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramel3A2AHA7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramel3A2AHA7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms