Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms