Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms