Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921501E09RikA0A0R4J054 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms